متن پیام دبیر شورای عالی امنیت ملی به شرح زیر است:
انالله و انا الیه راجعون
«عروج اسطوره مقاومت ملت مظلوم فلسطین، شهید والا مقام جناب آقای اسماعیل هنیه گرچه به مثابه ضایعه ای بس الیم و دردناک،داغی بزرگ بر دل های آحاد امت اسلام و به ویژه ملت شریف ایران بر جای نهاد.
اما نشان داد که دشمن زبون صهیونیست در میدان کماکان شکست خورده است و امید به هیچ دستاوردی در مقابله مستقیم با رزمندگان مقاومت ندارد و از این رو ترور را تنها گزینه‌ی باقیمانده در پیش روی خود می‌بیند.
شهید هنیه به نقطه نهایی آمال خویش دست یافت و با شهادتش، جریان عظیم مقاومت را وارد مرحله ای تاریخی کرد؛ با این حال به فرموده مقتدایمان، جمهوری اسلامی ایران از حق خونخواهی وی هرگز نخواهد گذشت و رژیم صهیونیستی پاسخی درخور دریافت خواهد کرد.
اینجانب این فقدان جانسوز را به محضر ولی عصر، رهبر معظم انقلاب، ملت غیور ایران و امت عزادار اسلامی تسلیت عرض می نمایم.»